Jupyter 自救日记(1)下载,配置 R,配置 R embed in Python,杂七杂八

下载 Jupyter Notebook

下载安装 Anaconda

Terminal:jupyter notebook 自动在网页里打开 Jupyter 主页,就可以写 Python 了。

注意:所有 Anaconda 环境下的 terminal 命令(conda …)都需要 quit Jupyter 之后才能使用。

杂项之一

pip --upgrade 升级一下

安装 JDK

装了 Jupyter 之后 terminal 老提示我没有 JDK,不知道为什么没人说过,反正装了没坏处。
JDK 8 官网下载,安装。
Terminal:java -version,出现 java version "1.8.0_191" 之类的提示就算成功了。

安装 IRkernel

首先电脑里要装了 R。
Terminal:conda install -c r r-essentials,遇到 y/n 一路 y 就行了。

安装扩展管理(nbextensions),安装目录扩展(TOC2)

Terminal:conda install -c conda-forge jupyter_contrib_nbextensions

打开 Jupyter,主页上方多了一个叫 Nbextensions 的标签,在里面搜索 Table of Contents (2), 点 Enable 就行了。
上图:

调整 R 输出图像尺寸

来源:这里


安装 rpy2(目前用不了)

Terminal:pip install rpy2

import rpy2
print(rpy2.__version__)


R embed in Python

Jupyter notebook(python):%load_ext rpy2.ipython

Troubleshooting

conda update r-essentials

Dead kernel 反复且无法自动重启:
conda install -c defaults zeromq  来源于这里

退出 (base)(Anaconda)环境:
source deactivate

导出 PDF

电脑里要装了 MacTeX

安装 nbconvert 通过 Anaconda 安装的版本默认自带。
Jupyter notebook:File > Download as > PDF via LaTeX

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