Jupyter 自救日记（1）下载，配置 R，配置 R embed in Python，杂七杂八

下载 Jupyter Notebook

下载安装 Anaconda。

Terminal：jupyter notebook 自动在网页里打开 Jupyter 主页，就可以写 Python 了。

注意：所有 Anaconda 环境下的 terminal 命令（conda …）都需要 quit Jupyter 之后才能使用。

杂项之一

pip --upgrade 升级一下

安装 JDK

装了 Jupyter 之后 terminal 老提示我没有 JDK，不知道为什么没人说过，反正装了没坏处。
JDK 8 官网下载，安装。
Terminal：java -version，出现 java version "1.8.0_191" 之类的提示就算成功了。

安装 IRkernel

首先电脑里要装了 R。
Terminal：conda install -c r r-essentials，遇到 y/n 一路 y 就行了。

安装扩展管理（nbextensions），安装目录扩展（TOC2）

Terminal：conda install -c conda-forge jupyter_contrib_nbextensions

打开 Jupyter，主页上方多了一个叫 Nbextensions 的标签，在里面搜索 Table of Contents (2)， 点 Enable 就行了。
上图：

调整 R 输出图像尺寸

来源：这里

安装 rpy2（目前用不了）

Terminal：pip install rpy2

import rpy2
print(rpy2.__version__)

R embed in Python

Jupyter notebook（python）：%load_ext rpy2.ipython

Troubleshooting

conda update r-essentials

Dead kernel 反复且无法自动重启：
conda install -c defaults zeromq  来源于这里

退出 (base)（Anaconda）环境：
source deactivate

导出 PDF

电脑里要装了 MacTeX。

安装 nbconvert 通过 Anaconda 安装的版本默认自带。
Jupyter notebook：File > Download as > PDF via LaTeX